Поляризационные микроскопы позволяют выявлять неоднородности (анизотропию) структуры при изучении строения тканей и образований в организме в поляризованном свете (визуализация изображения объекта в поляризованных лучах).
Поляризационный микроскоп широко используют в медико-биологических исследованиях при изучении препаратов крови, шлифов зубов, костей и т.п.